小門嶼位於西嶼島的北端，與西嶼有寬約20公尺的水道相隔，現築有小門橋連結兩島。全島面積雖然只有0.5平方公里，但小門嶼的地質地形景觀，卻是澎湖群島的縮影，有活的戶外地質教室之稱。
小門嶼是個地勢北高南低的熔岩台地，島上的東、北、西岸多為玄武岩海崖，南岸則為村落聚集地區。來到此處，可見到外形呈現球狀結構的多孔玄武岩，小門嶼層特殊的鐵質石英砂岩、鐵質黏土層、參雜動物化石的灰殼岩以及受流水侵蝕的小惡地形等多樣貌的地質景觀。
島上最著名的景點「鯨魚洞」，因外型近似鯨魚頭露出水面而得名。鯨魚洞原為一玄武岩海崖，經過海水侵蝕作用，不斷的侵蝕，終成現今的「海蝕拱門」，讓人認識了海蝕地形的演進過程。
當然小門嶼還有蜂巢田式的菜宅、石敢當等人文特色景觀，以及可到「小門地質館」一窺澎湖的地質奧秘的好機會，也千萬不要錯過！